Du kannst im SchiffSim selbst bei Optionen->Steuerung die "Tasten"belegung einstellen, was du sicherlich auch gemacht hast.Wenn man diese einstellen möchte, muss man doppelt auf eine der Einstellungen klicken und dann die gewünschte Bewegung ausführen.
Wenn du jetzt immer genau das gegenteilige ausführst, ist es im Sim dann richtig herum.
P.S.: Ich spreche aus eigener Erfahrung, denn bei meiner selbstgebauten Steuerung habe ich das gleiche Problem!

P.P.S.: Wenn du magst, darfst du auch gerne mal ein Bild von deiner Steuerung uns zeigen.