A priori, je ne pense pas, je pense que le mode de fonctionnement des versions précédentes sera conservé. Les missions incluses dans le jeu sont celles utilisées pour enregistrer les scores et les grades des joueurs, elles sont donc protégées, pour que les joueurs ne puissent pas les modifier, et que leurs scores soient comparables (puisque reposant sur les mêmes objectifs de mission).
En revanche, lorsque l'éditeur sera sorti - ce qui ne devrait pas trop tard - je suis sorti qu'une pléthore de nouvelles missions feront leur apparation, dont beaucoup seront mises à disposition par d'autres joueurs, et celles-ci seront modifiable à souhait.
Ce ne sont là toutefois que des spéculations, par rapport à ce que l'on a pu voir dans les versions précédentes du jeu, notamment ShipSim2008.